本澳原水与珠海同源，均来自磨刀门河口，每逢冬春季节，海水自河口向上游倒灌，使河道水体变鹹，形成鹹潮，影响供水质量。在2011年，粤澳两地签署《粤澳供水协议》，在珠海建立竹银水库，扩大储水量，缓解鹹潮。故此，近年鹹潮对本澳影响已极微，过去五年，本澳自来水鹹度，一直处于优质的绿色低鹹度级别。

海事及水务局局长黄穗文表示，特区政府与广东省，每年均会预早制定枯水期的鹹潮应对措施，提前检视珠海市各水库，储水量是否到位，再部署泵站的调度和蓄水计划。现时，水量调度和部署已经非常成熟。她表示，由于最近几年，西江枯水不太严重，加上鹹潮应对措施奏效，故本澳均能安全渡过枯水期，但她期望，市民不要因鹹潮影响已极微，而浪费食水，应持续珍惜食水及养成节水的习惯。